Установление советской власти вызвало вооруженное сопротивление свергнутых политических сил, что вылилось в гражданское противодействие, а затем в Гражданскую войну. В частности, уже в ноябре 1917 года против советской власти выступил атаман оренбургского казачества А. Дутов. Он возглавил отряды казаков численностью около семи тысяч. К весне 1918 года под его знаменами уже было 22 тыс. сабель и штыков. Очагом сопротивления советской власти также стало Семиречье, где в начале ноября 1917 года власть в свои руки взял казачий войсковой совет. В марте 1918 года в Гурьеве власть захватил генерал В. Толстое, провозгласивший себя атаманом Уральского казачества.

Главной ударной силой противников советской власти стал мятеж чехословацкого корпуса военнопленных, произошедший в мае 1918 года. Мятежники захватили ряд городов Сибири, Урала, Среднего Поволжья - Новосибирск, Челябинск, Томск, Омск. 31 мая контрреволюционеры взяли Петропавловск, в июне - Акмолинск, Атбасар, Кустанай, Павлодар, Семипалатинск. В результате Уральская, Акмолинская, Семипалатинская и большая часть Тургайской области оказались в руках белогвардейцев. В Сибири была установлена власть Временного сибирского правительства, во главе которого стал адмирал А.В. Колчак. К весне 1919 года под его командованием на фронте оказалось 130 тыс. солдат и офицеров.

В этих условиях Декретом ВЦИК от 29 мая 1918 года добровольность комплектования Красной Армии была заменена обязательной воинской повинностью. Летом 1918 года создавались национальные воинские формирования. Были образованы казахские, мусульманские, дунганские, уйгурские подразделения. В Гражданской войне вместе с трудящимися Казахстана принимали участие венгры, чехи, немцы, поляки и представители других народов. По некоторым данным, с января 1918 по декабрь 1919 года на территории Средней Азии и Казахстана было сформировано 20 национальных воинских подразделений. .

В стране развернулся «белый» и «красный» террор. Например, по официальным данным, в 1918 году органы ВЧК (Всероссийской чрезвычайной комиссии) репрессировали 31 489 человек, из них 6 185 расстреляли, 21 236 заключили в тюрьмы и лагеря. С другой стороны, только от рук колчаковцев погибли более 25 тыс. человек.

В ходе Гражданской войны территория Казахстана стала театром военных действий крупных общероссийских фронтов - Восточного, Туркестанского, Уральского, а также местных, локальных - Актюбинского и Семиреченского.

Летом 1918 года сложная обстановка сложилась в районе Оренбурга. 3 июля он был занят атаманом А. Дутовым, который перерезал Оренбургско-Ташкентскую железную дорогу. Красная армия отступала вдоль железной дороги к Актюбинску. Чтобы преградить продвижение белогвардейцев на юг к Ташкенту, был образован Актюбинский фронт. Командующим его стал Г.В. Зиновьев. Тогда же была организована экспедиция во главе с Чрезвычайным комиссаром Степного края А. Джангильдиным. Она вышла из Москвы 18 июля 1918 года с грузом обмундирования и вооружения на несколько тысяч человек и, проследовав по Волге, Каспийскому морю, через Мангышлак, 11 ноября прибыла в Челкар.

Алиби Джангильдин (1884-1953) родился в местечке Кайдаул Тургайского уезда. В 1903 году он окончил Оренбургское духовное училище, в 1904-1905 годах учился в Казанской учительской семинарии, а в 1906 году поступил в Московскую духовную академию. В 1910-1912 годах путешествовал по многим странам Европы, Ближнего Востока, Африки и Азии; в частности, он побывал в Польше, Австрии, Венгрии, Швейцарии, Сербии, Болгарии, Турции, Сирии, Палестине, Египте, Абиссинии, на Аравийском полуострове, Месопотамии, Иране, Индии, на острове Цейлон, на Малайском архипелаге, в Индокитае, в Южном Китае, на Тайване, в Японии. А. Джангильдин был одним из организаторов работы по созыву Первого Учредительного съезда Советов Казахстана [18].

Актюбинский фронт сыграл важную роль в Гражданской войне и, когда в октябре 1918 года белогвардейцы начали наступление на Актюбинск с целью прорваться в Среднюю Азию и в южные районы Казахстана, они были остановлены и отброшены. После того, как в 1919 году были освобождены Оренбург, Уральск, Орск и осенью войска Актюбинского фронта соединились с войсками Восточного фронта, он был упразднен.

Летом и осенью 1918 года активные боевые действия развернулись в Семиреченской области. Белогвардейцы стремились захватить Илийский край, Верный и далее двинуться на юг Казахстана и в Среднюю Азию. Были захвачены Сергиополь, Урджар, Сарканд и другие населенные пункты. С тем чтобы не допустить продвижения белогвардейцев на юг на этом направлении, летом 1918 года был образован Северный Семиреченский фронт. Основные его части располагались в селе Гавриловском (Талдыкорган), командующим фронтом был Л.П. Емелев. Осенью 1918 года Северное Семиречье было захвачено белогвардейцами, но в обширном районе Лепсинского уезда сохранилась еще власть Советов, центром ее стало село Черкасское. Оборона этого района вошла в историю как Черкасская оборона, длившаяся с июня 1918 по октябрь 1919 года. Специально, чтобы, сломить ее, из Семипалатинска была переброшена дивизия атамана Б. Анненкова.

В Казахстане в годы Гражданской войны широкий размах приобрели партизанское движение и народные восстания. Их центрами были Акмолинская и Семипалатинская области, особенно выделялись Кустанайское, Шемонаихинское и другие восстания, а также активные действия партизанских отрядов «Горные орлы», местом дислокации которых являлись Тарбагатай и Алтай.

Летом 1919 года главные силы армии адмирала А.В. Колчака на Восточном фронте потерпели поражение. Это создало условия для освобождения Западного, Северного, Восточного Казахстана и Семиречья. К концу года основная территория края была освобождена от белогвардейцев. В марте 1920 года был ликвидирован Северный Семиреченский фронт, последний на территории Казахстана.

Сразу же после Октябрьской революции в Казахстане декретами советской власти быстрыми темпами была осуществлена национализация крупных промышленных предприятий, банков, транспорта. Было национализировано только крупных промышленных предприятий более 300. В ходе Гражданской войны в целях мобилизации материальных ресурсов и их экономии были введены чрезвычайные меры, получившие название «военный коммунизм». Прежде всего, это касалось продовольственного вопроса. Здесь предусматривалось изъятие «излишков» продуктов, установление нормированного, централизованного снабжения ими и, в первую очередь, хлебом. Декретом СНК от 11 января 1919 года была введена продразверстка. Наряду с этим была установлена обязательная трудовая повинность. В обобщенном виде политика «военного коммунизма» включала в себя отмену рыночных, товарно-денежных отношений; замену экономических стимулов внеэкономическими, директивными; распространение на все сферы экономики жесткого государственного контроля; распространение уравниловки как воплощения идеи равенства.

Еще накануне Гражданской войны, сразу после установления советской власти, были ликвидированы прежние органы власти и создавались новые. Первым специальным органом управления Казахстаном в условиях советской власти стал Казахский отдел при Наркомате по делам национальностей РСФСР, образованный 11 мая 1918 года. А 10 июля 1919 года был принят декрет об образовании Кирревкома - Революционного комитета по управлению Киргизским (Казахским) краем.

В него вошли С. Пестковский (председатель), а также такие известные деятели, как А. Байтурсынов, Б. Каратаев, А. Джангильдин и др. В соответствии с декретом Казревком был «высшим военно-гражданским» органом управления краем, в территорию которого входили области: Уральская, Тургайская, Акмолинская, Семипалатинская, а также казахские земли Астраханской губернии. Но фактически Акмолинская и Семипалатинская области до первой половины 1921 года находились под началом Сибирского ревкома.

Главная задача Казревкома заключалась в подготовке автономии края. 26 августа 1920 года ВЦИК и СНК РСФСР приняли подписанный М.И. Калининым и В.И. Лениным Декрет «Об образовании Киргизской (Казахской) Советской Автономной социалистической республики» в составе РСФСР со столицей в Оренбурге. 4-12 октября 1920 года в Оренбурге состоялся Учредительный съезд Советов Казахстана. Он принял Декларацию прав трудящихся Казахской АССР, которая закрепила создание КАССР. Был избран ЦИК во главе с С. Мендешевым и СНК во главе с В. Радус-Зеньковичем. Территория республики составила около 2 млн. км², население около 5 млн. человек. В нее вошли Семипалатинская, Акмолинская, Тургайская, Уральская области, Мангышлакский уезд, часть Красноводского уезда, часть Астраханской губернии, населенной казахами. Две казахские области - Семиреченская и Сырдарьинская входили в Туркестанскую Советскую Федеративную республику, провозглашенную в Ташкенте 30 апреля 1918 года на V съезде Советов Туркестана, в которую вошел Туркестан, за исключением Хивы и Бухары.

30 декабря 1922 года был подписан договор об образовании СССР. Первоначально он состоял из четырех республик 4 РСФСР, УССР, БССР, ЗСФСР (куда входили Грузия, Азербайджан, Армения), Казахстан был в составе РСФСР.